GenoMEL logo
 
 
  GenoMEL is an international research consortium coordinated by the University of Leeds.
  University of Leeds
  ???????
  ????? ????????
  ?????????
  ????????
  ?????????
  ?????????? ??????
  ?????????? ?????????
  ??????????
  Exchange Programme
 

data sharing

  Knowledge Transfer
  ????? ???????????
  Stage III Melanoma Research Group
  PharmacoGenoMEL
  ????????? ? ???????????
  ????? ???????
  ????????????? ?????
  ?????
  ???????? ???????
  ????????? ???? ?? ?????? ?????
  ???????????
  GenoMEL is an international research consortium coordinated by the University of Leeds.
  Terms and Conditions
Privacy Statement
  Translations by: Artem Vyacheslavovich Kopelev
programme
 
first aim
   
Первая цель ГеноМЕЛ- была установление пропорции семей меланомы с наследственными мутациями в ген П16, (часть региона СДКН2А, смотри иллюстрацию) первая установленный ген восприимчивости меланомы. При введении Консорциума, число семей с установленной мутацией било не большое. Явный прогресс был установлен в связи определения новых мутаций, которые медленно увеличили пропорции семей с ранее опознаваемыми мутациями.
 
 

Выдвигающий протеин (промотер) был проверен но мутации не нашлись [1][2], с исключением кодической вариации найдена в начале только в Канадских семьях[3].

Нашлась глубокая интронная мутация объясняя высокую пропорцию Английских семей с меланомой[4], которая раньше была с меньшей пропорцией семей в группах Консорциума.

Доклад детальных съёмок интронов для других мутаций сдали на публикацию в Сентябре 2004 года.

В других наследственных раках, удаления в основных генах объяснили восприимчивость в приличной пропорции семей, поэтому детальные/всесторонний съёмки семей из Англии проведены и те результаты в публикации, тоже в Сентябре 2004. Съёмки образцов ГеноМел из модельной группы в прогрессе и будут готовы первого Декабря 2004.

Группы Консорциума обменялись пробами ДНК в 2004 году, сравнивая [DHPLC] съёмки мутаций и последовательности ген, и также анализируют съёмки по всему Консорциуму. Эти исследования ведущие Марком Харландом и Алисой Голдштеин уже завершаются и они доводят их до конца.

Наконец-то все эти данные объединяются, разрешая репортаж пропорций семей с зародышскими мутациями или удалениями по всему Консорциуму, смотря на количество пациентов в семье, тип рака, возраст заболевание и географическое место. Данные по поводу этого проекта можно представить Консорциуму на рассмотр до первого Декабря, 2004.

 
 

bullet Первая цель
bullet Вторая цель
bullet Третья цель
bullet Четвёртая цель
bullet Пятая цель
bullet Справки

   
second aim
   
Вторая цель Геномел- определить других ген восприимчивости на 9 хромосоме так как гаплотипные данные показали связь с этой хромосомой в семьях с обычным p16. Консорциум установил, что мутации действующие на эксон 1fl на локусе CDKN2A, который кодирует часть протеина P14АRF, поддерживают восприимчивость в некоторых семьях. Иллюстрация внизу показывает структуру этого локуса и альтернативное расщепление с результатом совершенно разных протеинов p16 и P14АRF.
 
 

Определение удалённого расстояния на хромосоме в семье на этом локусе показало, что генетическая потеря была только эксона 1fl и получилась первым доказательством что p14ARF это ген восприимчивости меланомы [5].

Испанская группа в ГеноМел в совмещении группы из Сидней сообщили нас о семье с вставленным эксоном 1fl с 16-ю базовых пар именно которая изменяет p14ARF, но не p16(INK4a) [6], и также подтверждает функцию p14ARF.

Впоследствии, вариации региона расщепления уже нашлись и доклад с этими результатами послали в редакцию в Октябре 2004.

 
 

bullet Первая цель
bullet Вторая цель
bullet Третья цель
bullet Четвёртая цель
bullet Пятая цель
bullet Справки

   
third aim
   
Третья цель ГеноМел- определить другиe гены восприимчивости меланомы.
 
 

Консорциум объявил соединение к 1p22 в сотрудствии с доктором Джеффри Трент и его группой, вначале в NIH и недавно в Translational Genomics Research Institute, Финикс, Аризона. Главный сотрудник здесь была Лиз Гилландерс [7].

Работа продолжается в определении этогo генa.

 
 

bullet Первая цель
bullet Вторая цель
bullet Третья цель
bullet Четвёртая цель
bullet Пятая цель
bullet Справки

   
third aim
   
Четвёртая цель ГеноМел- понять влияние наследства мутаций в CDKN2A смотря на риск меланомы и риск других раков.
 
 

Начальные анализы проникания меланомы объявили Консорциумом в 2002 году [8]. Эти исследования показали, что пробивания мутации CDKN2A бывает около .30(95% интервал уверенности (С1)=0.12 до 0.62) до 50 лет и .67 (95% С1=.31 до .96) до 80 лет.

Текущий анализ под направлением Тима Бишопа - оценить риск других раков кроме меланомы в носителях мутаций.

Третий анализ под направлением Флоренса Демене - обследовать проникание статуса MC1R.

 
 

bullet Первая цель
bullet Вторая цель
bullet Третья цель
bullet Четвёртая цель
bullet Пятая цель
bullet Справки

   
fifth aim
   

Пятая цель ГеноМел - исследовать взаимоотношение ген восприимчивости меланомы и родинок (меланоцитых naevi). Присутствие множественных и/или клинически-ненормальных naevi (синдром нетипичных родинок или фенотип диспластик naevus) оказывается самым мощным фактором риска меланомы, и доказательства существуют что фенотип генетически определён[9].

 
 

От ранних данных многие считали, что носители ген CDKN2A должны проявлять фенотип синдрома нетипичных родинок, но получилось не так в Английских [10] и Австралийских семьях участвующих в исследованиях ГеноМел. Собирая фенотипические данные от семьях по всему Консорциуму, мы целимся прояснить определитель важных факторов риска меланомы в этих семьях с меланомой.

 
 

bullet Первая цель
bullet Вторая цель
bullet Третья цель
bullet Четвёртая цель
bullet Пятая цель
bullet Справки

   
   
Справки
 

1. Harland, M., et al.,
Mutation screening of the CDKN2A promoter in melanoma families.
Genes Chromosomes Cancer, 2000. 28(1): p. 45-57.

2. Pollock PM, et al.,
Mutation analysis of the CDKN2A promoter in Australian melanoma families.
Genes Chromosomes Cancer. 2001 32(1):p 89-94.

3. Liu, L., et al.,
Mutation of the CDKN2A5'UTR creates an aberrant initiation codon and predisposes to melanoma.
Nature Genetics, 1999. 21: p. 1-5.

4. Harland, M., et al.,
A deep intronic mutation in CDKN2A is associated with disease in a subset of melanoma pedigrees.
Hum Mol Genet, 2001. 10(23): p. 2679-86.

5. Randerson-Moor, J.A., et al.,
A germline deletion of p14(ARF) but not CDKN2A in a melanoma-neural system tumour syndrome family.
Hum Mol Genet, 2001. 10(1): p. 55-62.

6. Rizos, H., et al.,
A melanoma-associated germline mutation in exon 1beta inactivates p14ARF.
Oncogene, 2001. 20(39): p. 5543-7.

7. Gillanders, E., et al.,
Localization of a novel melanoma susceptibility locus to 1p22.
Am J Hum Genet, 2003. 73(2): p. 301-13.

8. Bishop, D.T., et al.,
Geographical variation in the penetrance of CDKN2A mutations for melanoma.
J Natl Cancer Inst, 2002. 94(12): p. 894-903.

9. Wachsmuth, R.C., et al.,
Heritability and gene-environment interactions for melanocytic nevus density examined in a U.K. adolescent twin study.
J Invest Dermatol, 2001. 117(2): p. 348-52.

10. Newton Bishop, J., et al.,
Genotype/phenotype and penetrance studies in melanoma families with germline CDKN2A mutations.
J Invest Dermatol, 2000. 114: p. 28-33.

 

bullet Первая цель
bullet Вторая цель
bullet Третья цель
bullet Четвёртая цель
bullet Пятая цель
bullet Справки

   
 
 
   
website design: NKD | email: info@NKD.org.uk | site: www.NKD.org.uk